“桃花影落飞神剑，碧海潮生按玉箫。”东邪黄药师出生于云南一带，在年纪很小的时候便练成了武功。他练成武功后与家里有了嫌隙，一怒之下远赴浙江一带（他本来就是浙江世家），行侠仗义，屡屡与朝廷作对，所作所为都是百姓平时敢怒不敢言的事情，因而被百姓尊为邪怪大侠。
在他四十余岁时，全真教祖师王重阳广发英雄帖，遂携帖上了华山之巅，与西毒欧阳锋、南帝段智兴、北丐洪七公、中神通王重阳斗了七日七夜，最终被武林群豪尊为东邪。
黄药师仿佛一束光，谁若接近他，便是接近光。他武功盖世，名满天下，天文地理，奇门五行，琴棋书画，炼丹制药，机关易理可谓无所不通，无所不精，其人才华横溢，非金书任何一人所能及。
晚年以后，他云游天下，潇洒如风，可谓是神龙见首不见尾，通读《神雕侠侣》一书，他一共才出现那么几次，每次均是郭靖、黄蓉一家子有难时他才出现，事情办好了以后，便事了拂衣去，深藏身与名，其下落谁也不知道。
当日杨过飞石击毙蒙哥后，《神雕》一书就此结束，随着杨过的离去，黄药师、周伯通、一灯大师这批老一辈惊才绝艳的高手也谢幕了，别人咱们暂且不提，单单说说黄药师，他谢幕之后，隐居在何方？
当日灭绝师太不愿受辱，不愿接受明教的人情，遂决定一死了之，临死前她将关于郭靖、黄蓉以及倚天、屠龙的秘密告诉了周芷若，其中提到一条很重要的内容，这段内容也彻底揭开了黄药师的死因——“至于那部武学秘笈，则主要是一部《九阴真经》，再加上郭祖师外公黄岛主的某些绝学、郭大侠夫妇的**九指神丐的精妙武功。《九阴真经》中有一部分是速成的武功，可惜给黄岛主另外两个**练错了，黄岛主心伤**之死，设法予以纠正，使得既可速成，而后患亦属有限。郭大侠夫妇将这兵法秘笈藏在一个绝顶机密的所在，另在两块玄铁铁片之上，刻上了这所在的地图，并注明进入的方法，将铁片藏入了倚天剑和屠龙刀之中。”
从这段话可以看出，黄药师参与了“倚天屠龙计划”的整个过程！周芷若后来所修炼的速成版《九阴真经》，正是由黄药师修正而来。
郭靖、黄蓉在襄阳城破前不久，拟定了这项计划，不久后夫妇二人便殉难襄阳城中，而黄药师也是整个计划的参与者，所以他当时必然在襄阳城内，那么黄药师有没有可能与郭靖、黄蓉一起死在襄阳城呢？
可能性不大，周芷若得到刀剑地图后，按图索骥来到了桃花岛，并在一个山洞中找到了秘籍（这个山洞极大可能就是当日关押周伯通的山洞），郭靖、黄蓉要镇守襄阳，所以藏秘籍之人不会是他们；郭芙鲁莽，郭靖、黄蓉并未将这个秘密告知她，所以藏秘籍之人也不会是他；郭襄、郭破虏显然不知秘籍所在，否则郭靖、黄蓉何必再铸造刀剑给他们，岂不是多此一举？
世上除了郭靖、黄蓉、郭芙、郭襄、郭破虏、黄药师外，再无人懂得桃花岛机关，上文提到黄药师参与了倚天屠龙计划，所以这个藏秘籍之人不是黄药师又是谁呢？
自此真相大白，黄药师最终带着秘籍回到桃花岛，从此隐居在这座岛屿之中，岁尽而亡。
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