孔雀鱼在自然环境中是会进行近亲繁殖的，因为它们是群居动物，经常会与自己的亲戚进行繁殖。但是在人工饲养的环境中，为了确保孔雀鱼的健康和避免近亲繁殖带来的负面影响，一般不建议让孔雀鱼进行近亲繁殖。
近亲繁殖可能会导致孔雀鱼出现遗传缺陷和健康问题，如身体畸形、寿命缩短等。此外，近亲繁殖还可能导致孔雀鱼品种退化，因为基因型相似的个体进行繁殖时，基因突变的可能性较低，从而导致后代品种缺乏多样性。
在人工饲养孔雀鱼时，建议使用不同品种或不同家族的孔雀鱼进行繁殖，以避免近亲繁殖带来的问题。同时，为了确保孔雀鱼的健康和品质，应该选择健康的个体进行繁殖，并注意保持水质和提供适当的营养。
总之，虽然孔雀鱼在自然环境中可以进行近亲繁殖，但在人工饲养的环境中不建议这样做，以避免潜在的健康和遗传问题。
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