揭開生命的奧秘 釋放二代測序的力量!

2023-07-26 15:28:33 字數 2509 閱讀 9669

自watson和crick在2023年公布了dna雙螺旋結構以來,測序技術領域展現了顯著的進步並一直在持續發展。2023年,英國生物化學家laureate frederick sanger發明了雙脫氧鏈終止法核酸測序技術,該方法自此被認為是核酸測序的金標準。基於發明者的名字,這一方法也被稱為sanger測序法。以sanger測序為代表的第一代dna測序技術支援完成了人類基因組計畫,大大促進了人類對自身遺傳編碼資訊的了解。隨著人類基因組計畫的完成,人們進入了功能基因組時代,傳統的測序方法已經不能滿足深度測序和重複測序等大規模基因組測序的需求,這促使了第二代dna測序技術(next-generation sequencing, ngs)的誕生。ngs測序技術最顯著的特徵是高通量,一次可對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測序,大大降低了測序成本的同時,還大幅提高了測序速度,並且維持了高準確性,但在序列讀取長度方面普遍偏低。ngs測序已經被廣泛應用於基因組學領域,並在研究、醫學和工業的各個領域有許多應用。以下是ngs測序的一些常見的應用:基因組研究:ngs能夠全面分析生物體的整個基因組,促進遺傳變異、基因表達和基因組結構的研究。研究人員可以調查疾病的遺傳基礎,識別疾病相關基因,並了解人類遺傳變異的複雜性。

癌症基因組學:ngs有助於了解驅動癌症發展和進展的基因突變和改變。它可用於識別特定突變,評估腫瘤異質性,並指導個性化的**選擇,如靶向**和免疫**。

微生物基因組學:ngs允許對微生物基因組進行測序和定性,有助於鑑定病原體,了解微生物多樣性,並研究微生物在各種環境中的作用,包括人類微生物組。

臨床診斷學:ngs在臨床診斷學中具有變革性的潛力。它能夠識別致病突變、遺傳傾向、腫瘤和罕見遺傳疾病,為精準醫療提供基礎資料。基於ngs的檢測可用於產前篩查、攜帶者檢測和遺傳疾病診斷。

傳染病監測:ngs可以跟蹤和監測傳染病的傳播,如病毒暴發或抗菌素耐藥性。它能夠快速識別和鑑定病原體,促進有效的公共衛生應對措施。

農業和食品安全:ngs可用於通過識別與理想性狀相關的基因來加強作物育種計畫,提高植物育種效率,並通過檢測食品中的汙染物和病原體來確保食品安全。

法醫學分析:ngs也常被使用在人類鑑定、親子鑑定和刑事調查等法醫遺傳學中。它可以從微小的樣本中提供高度靈敏和準確的dna圖譜。

這些只是ngs測序廣泛應用的幾個例子。這項技術不斷發展,其不斷提高的速度、準確性和成本效益為各個領域開闢了新的可能性。探索合成生物學的過程中,泓迅科技在dna測序領域積累了非常深厚的經驗。我們建立的sanger雙脫氧終止法分析平台,適用於普通轉殖以及合成類的專案測序,通過新一代測序技術(ngs)進行工程類或大規模的篩選專案篩選靶點。我們經驗豐富的工程師利用先進的實驗裝置,為遍布全球的科研工作者提供穩定可靠的基因測序及生物資訊分析服務。

基因組dna測序能使研究人員獲得部分基因組的序列資訊,也可以從任意**的生物體中發現新的基因組序列。針對**於各種生物體和組織型別的樣本,我們提供多種相關服務,包括文庫製備、測序和資料分析等。這些實驗的實際應用包括遺傳變異分析以及通過從頭(de novo)組裝發現新的基因等。我們提供快速高質量的轉錄組測序,轉錄組測序廣泛應用於基因表達圖譜、snp檢測、可變剪接和轉錄本注釋等。我們研發的特異性文庫製備方法能夠滿足高度特異性和較低樣品輸入量的要求。srna測序可以同時檢測mirna, sirna和pirna。其中mirna分析在發現新的生物標記mirna表達圖譜以及mirna靶基因的尋找方面有著廣泛的應用。針對**於各種生物體和組織型別的總rna樣本,我們為您提供srna文庫製備、測序和資料分析等服務。擴增測序是對pcr產物進行測序,具有更高的閱讀深度和覆蓋度。不僅能進行精確的變異篩選,還可以對低頻突變進行精密檢測。擴增測序可以一次對任意**的數百個pcr擴增子完成序列測定。擴增子測序產品主要包含16s、18s和its區域擴增測序,可以對環境、腸道等各種樣品的微生物多樣性進行研究。細菌多樣性採用16s擴增測序,真菌多樣性採用its擴增測序,同時對乙個環境的細菌和真菌多樣性研究可以對乙個樣品同時進行16s和its擴增測序。[1] levy s e , myers r m .advancements in next-generation sequencing[j]. annu rev genomics hum genet, 2016, 17(1): 95-115.doi: 10.1146/annurev-genom-083115-022413.[2] hu t, chitnis n, monos d, et al. next-generation sequencing technologies: an overview [j]. human immunology, 2021. doi: 10.1016/j.humimm.[3] ayman, grada, kate, et. next-generation sequencing: methodology and application [j]. journal of investigative dermatology, 2013. doi: 10.1038/jid.2013.248.

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