我們對人體內數千種蛋白質幾乎一無所知

2023-08-09 21:03:01 字數 1212 閱讀 3300

科學家們創造了一種由人類基因編碼的“未知數”蛋白質,其存在是已知的,但其功能卻大多未知

人類中已鑑定出大約 20,000 個編碼蛋白質的基因,但其中許多蛋白質的功能尚不清楚乙個被稱為“未知數”的蛋白質資料庫根據我們對蛋白質的了解程度對蛋白質進行排名,結果表明我們仍然對數千種人類蛋白質幾乎一無所知。該資料庫背後的團隊還表明,至少其中一些蛋白質對於生存至關重要。

為了創造未知生物,英國劍橋 mrc 分子生物學實驗室的肖恩·蒙羅 (sean munro) 和他的同事從人類中已發現的大約 20,000 個蛋白質基因開始。他們根據可能具有相似功能的密切相關的人類基因或蛋白質將它們分組在一起,產生了大約 7500 個蛋白質簇。

接下來,他們將在常見研究的動物(例如小鼠或果蠅)中發現的密切相關的蛋白質新增到這些簇中,因為這些蛋白質可能也具有相同的功能。然後,他們根據基因功能資訊主儲存庫(稱為基因本體資源)中有關其成員的條目數量,給每個蛋白質簇打分。

如果在另一種動物中對等效蛋白質進行了充分研究,則尚未直接研究的人類蛋白質仍然得分很高。對於被認為更可靠的條目(例如已在期刊上發表的條目),蛋白質也會獲得更高的分數。蒙羅說,評分有點隨意,但在試圖找出我們不知道的東西時,這是不可避免的。

研究得最充分的蛋白質的得分遠遠超過 100。例如,一種參與胚胎發育的名為 sonic hidehog 的蛋白質得分為 168,而有助於阻止細胞癌變的 p53 得分為 126。然而,超過 2200 種蛋白質分數低於 分數低於 1、超過 800 分數為 0。

理論上,這些低分蛋白質可能沒有被研究過,因為它們沒有做任何重要的事情。為了了解這些蛋白質是否重要,研究小組使用了一種稱為 rna 干擾 (rnai) 的技術來降低果蠅中 260 種得分低於 1 的蛋白質的水平。在 60 個案例中,果蠅死亡,表明這些特殊蛋白質具有重要的功能。

蒙羅說,這對研究果蠅的團隊成員來說是乙個很大的驚喜。 “他們只是假設所有可能的重要基因都已被發現,當然事實證明這不是真的。”

他說,未知蛋白質的數量正在慢慢減少,但他希望這些發現能夠加快發現的步伐。目前的問題是,資助機構和個人研究人員都不願意冒險研究未知的蛋白質,以防它們沒有做任何重要的事情。

甚至可能存在我們不知道的生物過程,”蒙羅說。 “沒有人在尋找它們所涉及的蛋白質,因為沒有人知道它們。”他說,這聽起來可能令人驚訝,但被稱為 crispr 的基因編輯技術基於細菌蛋白質,其功能直到 2012 年才被發現。

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